HADA
(Synonyms: HCC-Amino-D-alanine hydrochloride) 目录号 : GC50533HADA(HCC-氨基-D-丙氨酸盐酸盐)是一种蓝色荧光D-氨基酸(FDAA),适用于标记活细菌中的肽聚糖,激发/发射λ ~405/460 nm。
Cas No.:2253733-10-5
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
HADA (HCC-amino-D-alanine hydrochloride) is a blue fluorescent D-amino acid (FDAA), which is suitable for peptides in living bacteria, which stimulates/emitted λ ~ 405/460 nm. Without affecting the growth rate, FDAA can effectively conduct an external peripheral and diaphragm marking of different bacterial cell groups to display mitochondrial permeability[1-2].
The D-FDAA probe can marked PG growth sites in a series of different bacteria. FDAA is mixed with PG through DD transpeptidase (penicillin binding protein, PBP) or LD transpeptidase (LDT) (if existence). FDAA can be marked with species in a fast growth process in only 30 seconds, such as E. coli. HADA is capable of reproducible, stable labeling of PG for most bacterial species, usually without extensive optimization[1-3].
References:
[1] Botella H, Yang G, Ouerfelli O, et al. Distinct spatiotemporal dynamics of peptidoglycan synthesis between Mycobacterium smegmatis and Mycobacterium tuberculosis[J]. MBio, 2017, 8(5): 10.1128/mbio. 01183-17.
[2] Peters K, Pazos M, Edoo Z, Hugonnet JE, Martorana AM, Polissi A, VanNieuwenhze MS, Arthur M, Vollmer W. Copper inhibits peptidoglycan LD-transpeptidases suppressing β-lactam resistance due to bypass of penicillin-binding proteins. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Oct 16;115(42):10786-10791.
[3] Mendes S S, Marques J, Mesterházy E, et al. Synergetic antimicrobial activity and mechanism of clotrimazole-linked CO-releasing molecules[J]. ACS bio & med Chem Au, 2022, 2(4): 419-436.
HADA(HCC-氨基-D-丙氨酸盐酸盐)是一种蓝色荧光D-氨基酸(FDAA),适用于标记活细菌中的肽聚糖,激发/发射λ ~405/460 nm。在不影响生长速率的情况下,FDAA能够对不同细菌细胞群进行有效的外周和隔膜标记,显示线粒体外膜通透性[1-2]。
D-氨基酸(FDAA)探针可以在一系列不同的细菌中标记 PG 生长位点。FDAA通过DD转肽酶(青霉素结合蛋白,PBP)或LD转肽酶(LDT)(如果存在)掺入PG 中。FDAA只需30秒即可标记处于快速生长过程的物种,如大肠杆菌。HADA 能够可复制的,稳定的标记大多数细菌物种的PG,通常无需大量优化[1-3]。
本方案仅提供一个指导,请根据您的具体需要进行修改。
1. 提前准备以下溶液:TSB(或LB)、TSB(LB)琼脂平板、50 mM HADA原液(溶于DMAO)、10×和1×柠檬酸钠缓冲液、1×PBS和3%多聚甲醛。
2. 在冰上解冻细菌菌株的甘油原液。使用接种环将菌株划线接种在TSB琼脂平板上,并在 37 °C下孵育过夜。之后用单个细菌菌落接种25 ml TSB(或LB)培养基,并在37 °C下孵育过夜。
3. 将过夜培养物在TSB(或LB)培养基中稀释至OD578为0.1,并在37 °C下生长,直到其达到指数OD578为0.4。
4. 使用37°C预热的TSB(或LB)将细菌稀释至OD578为0.1,取500 μl置于无菌1.5 ml微管中。
5. 将2.5 µl 50 mM HADA储备液加入到样品中,使最终浓度达到 250 μM,并在37 °C下振荡孵育30分钟。
6. 将最终体积十分之一的提前预冷的10×柠檬酸钠缓冲液(50 µl,pH 2.25)加入到正在生长的培养物中。
7. 在4 °C下以16,200 xg的速度将样品离心2分钟。吸弃上清,使用1.5 ml冰冷的1×柠檬酸钠缓冲液(pH 3.0)重悬沉淀。
8. 在4 °C下以16,200 xg的速度将样品离心2分钟。吸弃上清,使用1.5 ml冰冷的1×PBS(pH 7.4)重悬沉淀,然后再次离心样品。用冰冷的 1×PBS(pH 7.4)重复清洗步骤一次。小心地吸弃上清,不要接触细菌沉淀。
9. 将细菌沉淀物悬浮于12.5 µl 1×PBS和12.5μl 3%多聚甲醛中,进行细菌固定。用移液器充分混合,并储存在冰上或4 °C条件下,直至进行显微镜分析。
10.显微镜分析:将3 μl固定细菌移入准备好的显微镜琼脂糖载玻片的孔中,小心地将方形盖玻片放在上面,轻轻按压。使用配备Cool SNAP HQ2CCD 相机的Eclipse Ti显微镜(Plan Fluor×100/1.30 Oil Ph3 DLL物镜)分析标记细菌,使用相差和DAPI通道(激发波长为 350/50 nm,发射波长为460/50 nm)。100 ms的曝光时间进行相差分析,1 s的曝光时间进行荧光图像分析。
注意事项:
1. 使用前需使用0.22 μm滤膜过滤并冰上预冷10×和1×柠檬酸钠缓冲液、1×PBS和3%多聚甲醛溶液。
2. HADA在酸性pH值或无缓冲水中几乎不发出荧光,在pH值高于7.0 时成像的细菌显示出 HADA 标记的最大亮度。最后两个清洗步骤至关重要。
3. 固定后应立即对标记细菌进行显微镜分析。
4. 此方案,所有分析的细菌都完全标记,在收缩细菌的隔膜处显示出更强的信号。向生长细菌中添加10×柠檬酸钠缓冲液,用pH值3.0的1×柠檬酸钠缓冲液进行初步清洗,并在冰上快速处理样品,可以改善未掺入的HADA的去除,并导致背景荧光信号降低和信号检测改善。
参考文献:
[1] Peters K, Pazos M, VanNieuwenhze M S, et al. Optimized Protocol for the Incorporation of FDAA (HADA Labeling) for in situ Labeling of Peptidoglycan[J]. Bio-protocol, 2019, 9(15): e3316-e3316.
Cas No. | 2253733-10-5 | SDF | |
别名 | HCC-Amino-D-alanine hydrochloride | ||
Canonical SMILES | N[C@@H](C(O)=O)CNC(C1=CC(C=CC(O)=C2)=C2OC1=O)=O.Cl | ||
分子式 | C13H12N2O6.HCl | 分子量 | 328.71 |
溶解度 | DMSO : 125 mg/mL (380.27 mM; Need ultrasonic) | 储存条件 | Store at -20°C |
General tips | 请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液;一旦配成溶液,请分装保存,避免反复冻融造成的产品失效。 储备液的保存方式和期限:-80°C 储存时,请在 6 个月内使用,-20°C 储存时,请在 1 个月内使用。 为了提高溶解度,请将管子加热至37℃,然后在超声波浴中震荡一段时间。 |
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Shipping Condition | 评估样品解决方案:配备蓝冰进行发货。所有其他可用尺寸:配备RT,或根据请求配备蓝冰。 |
制备储备液 | |||
1 mg | 5 mg | 10 mg | |
1 mM | 3.0422 mL | 15.211 mL | 30.422 mL |
5 mM | 0.6084 mL | 3.0422 mL | 6.0844 mL |
10 mM | 0.3042 mL | 1.5211 mL | 3.0422 mL |
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量) | ||||||||||
给药剂量 | mg/kg | 动物平均体重 | g | 每只动物给药体积 | ul | 动物数量 | 只 | |||
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶于水的药物;不同批次药物配方比例不同,请联系GLPBIO为您提供正确的澄清溶液配方) | ||||||||||
% DMSO % % Tween 80 % saline | ||||||||||
计算重置 |
计算结果:
工作液浓度: mg/ml;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL,
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL saline,混匀澄清。
1. 首先保证母液是澄清的;
2.
一定要按照顺序依次将溶剂加入,进行下一步操作之前必须保证上一步操作得到的是澄清的溶液,可采用涡旋、超声或水浴加热等物理方法助溶。
3. 以上所有助溶剂都可在 GlpBio 网站选购。
Quality Control & SDS
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