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N-methyl Mesoporphyrin IX

(Synonyms: N-甲基中卟啉IX) 目录号 : GC44416

N-methyl Mesoporphyrin IX(NMM)是卟啉的过渡态类似物,是亚铁螯合酶的有效抑制剂,Kd值为7 nM。N-methyl Mesoporphyrin IX是G-四链体的特异性染色剂,激发/发射最大值分别为399/610 nm。

N-methyl Mesoporphyrin IX Chemical Structure

Cas No.:142234-85-3

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Description

N-methyl Mesoporphyrin IX (NMM) is a transition state analog of porphyrin and an effective inhibitor of ferrochelatase with a Kd value of 7nM[1]. N-methyl Mesoporphyrin IX is a specific stain for G-quadruplexes, with excitation/emission maxima at 399/610 nm[2, 3]. G-quadruplexes (G4s) are higher-order structures formed by DNA or RNA sequences rich in tandem guanine repeats, and are stabilized by G-quartets through π-π stacking[4]. N-methyl Mesoporphyrin IX can serve as an effective probe for monitoring Aβ-amyloid aggregation in live cells related to Alzheimer's disease[5]. N-methyl Mesoporphyrin IX can stabilize human telomeric DNA dAG3 (TTAG3)3 (Tel22) and selectively bind to its parallel conformation with a 1:1 stoichiometry and a binding constant of approximately 1.0 × 105 M−1[6].

References:
[1] Xu L, Qi Q, Zhu J, et al. N-Methyl Protoporphyrin IX: An Understudied Porphyrin[J]. Chemical research in toxicology, 2022, 35(12): 2186-2193.
[2] Paramasivan S, Bolton P H. Mix and measure fluorescence screening for selective quadruplex binders[J]. Nucleic acids research, 2008, 36(17): e106-e106.
[3] Koralewska N, Szczepanska A, Ciechanowska K, et al. RNA and DNA G-quadruplexes bind to human dicer and inhibit its activity[J]. Cellular and Molecular Life Sciences, 2021, 78(7): 3709-3724.
[4] Kolesnikova S, Curtis E A. Structure and function of multimeric G-quadruplexes[J]. Molecules, 2019, 24(17): 3074.
[5] Li M, Zhao A, Ren J, et al. N-Methyl mesoporphyrin IX as an effective probe for monitoring Alzheimer’s disease β-amyloid aggregation in living cells[J]. ACS Chemical Neuroscience, 2017, 8(6): 1299-1304.
[6] Nicoludis J M, Barrett S P, Mergny J L, et al. Interaction of human telomeric DNA with N-methyl mesoporphyrin IX[J]. Nucleic acids research, 2012, 40(12): 5432-5447.

N-methyl Mesoporphyrin IX(NMM)是卟啉的过渡态类似物,是亚铁螯合酶的有效抑制剂,Kd值为7 nM[1]。N-methyl Mesoporphyrin IX是G-四链体的特异性染色剂,激发/发射最大值分别为399/610 nm[2, 3]。G-四链体(G-quadruplex)是由富含串联重复鸟嘌呤的DNA或 RNA折叠形成的高级结构,由G-四分体(G-quartet)通过π-π堆积形成[4]。N-methyl Mesoporphyrin IX可以作为监测阿尔茨海默病活细胞中Aβ-淀粉样蛋白聚集的有效探针[5]。N-methyl Mesoporphyrin IX可以稳定人端粒DNA dAG3 (TTAG3)3 (Tel22),并且对其平行构象具有选择性,以 1:1 化学计量比结合,结合常数约为1.0 × 105 M−1[6]

实验参考方法

本方案仅提供一个指导,请根据您的具体需要进行修改。

1. 溶液配制
(1)储存液:用DMSO溶解N-methyl Mesoporphyrin IX,终浓度为5-10mg/mL,可根据实际需要对储存液浓度进行调整。
注意:未使用的储存液分装后在-20℃避光保存,避免反复冻融。

(2)工作液:用实验缓冲液稀释储存液到所需的工作浓度。
注意:最佳的工作浓度请根据实际情况调整或参阅文献自行设置梯度浓度进行摸索。工作液必须现配现用。保证DMSO含量低于千分之一(1‰)。

2.使用N-methyl Mesoporphyrin IX对凝胶内G-四链体染色的实验步骤[1](来自文献,仅做参考)
(1)将200 pmol的非标记寡聚物在20μL 50mM KCl中折叠。将折叠的寡聚物与20μL上样缓冲液混合。取20μL混合样品加载到含有5%甘油的12%聚丙烯酰胺凝胶上。
(2)进行电泳实验,电泳结束后将凝胶取下用于染色
(3)准备N-methyl Mesoporphyrin IX储备液(5 mg/mL),溶于0.2 M HCl。
(4)准备N-methyl Mesoporphyrin IX工作液(1 μg/mL),用20 mM Tris(pH 7.6)、100 mM KCl、1 mM EDTA稀释。浸没凝胶孵育20分钟。
(5)使用荧光图像分析仪在532nm波长下扫描凝胶。

3.使用N-methyl Mesoporphyrin IX测定Aβ40的实验步骤[2](来自文献,仅做参考)
(1)作为离体探针(ex situ probe):将N-methyl Mesoporphyrin IX加入已孵育的Aβ40溶液中,浓度为1 μM。
(2)作为原位抑制剂(in situ inhibitor):将N-methyl Mesoporphyrin IX(10 μM)与Aβ40(50 μM)在37°C下共孵育7天。在荧光测量前加入额外的N-methyl Mesoporphyrin IX,使浓度保持在1 μM。
(3)使用荧光图像分析仪在激发波长399 nm下,收集550到700 nm范围内N-methyl Mesoporphyrin IX的光谱数据。

References:
[1]Koralewska N, Szczepanska A, Ciechanowska K, et al. RNA and DNA G-quadruplexes bind to human dicer and inhibit its activity[J]. Cellular and Molecular Life Sciences, 2021, 78(7): 3709-3724.
[2]Li M, Zhao A, Ren J, et al. N-Methyl mesoporphyrin IX as an effective probe for monitoring Alzheimer’s disease β-amyloid aggregation in living cells[J]. ACS Chemical Neuroscience, 2017, 8(6): 1299-1304.

化学性质

Cas No. 142234-85-3 SDF
别名 N-甲基中卟啉IX
化学名 8,13-diethyl-3,7,12,17,23-pentamethyl-21H,23H-porphine-2,18-dipropanoic acid
Canonical SMILES CC1=C2[NH]C(/C=C(C(CCC(O)=O)=C3C)\[N]=C3/C=C4[N](C)/C(C(C)=C\4CC)=C\C5=[N]/C(C(C)=C5CC)=C\2)=C1CCC(O)=O
分子式 C35H40N4O4 分子量 580.7
溶解度 15mg/mL in DMSO, 20mg/mL in DMF 储存条件 Store at -20°C,protect from light
General tips 请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液;一旦配成溶液,请分装保存,避免反复冻融造成的产品失效。
储备液的保存方式和期限:-80°C 储存时,请在 6 个月内使用,-20°C 储存时,请在 1 个月内使用。
为了提高溶解度,请将管子加热至37℃,然后在超声波浴中震荡一段时间。
Shipping Condition 评估样品解决方案:配备蓝冰进行发货。所有其他可用尺寸:配备RT,或根据请求配备蓝冰。

溶解性数据

制备储备液
1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7221 mL 8.6103 mL 17.2206 mL
5 mM 0.3444 mL 1.7221 mL 3.4441 mL
10 mM 0.1722 mL 0.861 mL 1.7221 mL
  • 摩尔浓度计算器

  • 稀释计算器

  • 分子量计算器

质量
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浓度
x
体积
x
分子量
 
 
 
*在配置溶液时,请务必参考产品标签上、MSDS / COA(可在Glpbio的产品页面获得)批次特异的分子量使用本工具。

计算

动物体内配方计算器 (澄清溶液)

第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
给药剂量 mg/kg 动物平均体重 g 每只动物给药体积 ul 动物数量
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶于水的药物;不同批次药物配方比例不同,请联系GLPBIO为您提供正确的澄清溶液配方)
% DMSO % % Tween 80 % saline
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