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Palmitic Acid Alkyne

(Synonyms: 15-十六碳炔酸,Alk-14) 目录号 : GC40292

Palmitic Acid Alkyne是一种具有ω端炔的棕榈酸,其化学试剂与含有叠氮基团的分子作为烷基链型PROTAC连接剂。

Palmitic Acid Alkyne Chemical Structure

Cas No.:99208-90-9

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Description

Palmitic Acid Alkyne is a palmitic acid with an ω-terminal alkyne and a click chemistry reagent acting as an alkyl chain-based PROTAC linker with molecules containing azide groups[1]. Palmitic acid alkyne is applied in protein detection, conjugative traffic binding, imaging assistive vectors, and PROTAC linkers [2,3,4,5].

References:
[1] Honcharenko, Dmytro et al. “New Alkyne and Amine Linkers for Versatile Multiple Conjugation of Oligonucleotides.” *ACS omega* vol. 6,1 579-593. 18 Dec. 2020, doi:10.1021/acsomega.0c05075
[2] Yap, Megan C et al. “Rapid and selective detection of fatty acylated proteins using omega-alkynyl-fatty acids and click chemistry.” *Journal of lipid research* vol. 51,6 (2010): 1566-80. doi:10.1194/jlr.D002790
[3] García-Cazorla, Yolanda et al. “Conjugation inhibitors compete with palmitic acid for binding to the conjugative traffic ATPase TrwD, providing a mechanism to inhibit bacterial conjugation.” *The Journal of biological chemistry* vol. 293,43 (2018): 16923-16930. doi:10.1074/jbc.RA118.004716
[4] Paiva, Eduardo M, and Florian M Schmidt. “Ultrafast Widefield Mid-Infrared Photothermal Heterodyne Imaging.” *Analytical chemistry* vol. 94,41 (2022): 14242-14250. doi:10.1021/acs.analchem.2c02548
[5] Gao, Xinxin, and Rami N Hannoush. “A Decade of Click Chemistry in Protein Palmitoylation: Impact on Discovery and New Biology.” *Cell chemical biology*vol. 25,3 (2018): 236-246. doi:10.1016/j.chembiol.2017.12.002

Palmitic Acid Alkyne是一种具有ω端炔的棕榈酸,其化学试剂与含有叠氮基团的分子作为烷基链型PROTAC连接剂[1]。棕榈酸炔应用于蛋白质检测、共轭交通结合、成像辅助载体和PROTAC连接物[2,3,4,5]

实验参考方法

点击棕榈酰化试验

1.HEK293T细胞铺板,用质粒(YKT6-WT BioID、YKT6-3E BioID和Wnt3A)转染添加10%胎牛血清的DMEM中。

2.ω-炔基棕榈酸(Palmitic Acid Alkyne)在乙醇中溶解至终浓度为50mM,保存于- 80°C。

3.将Palmitic acid alkyne在添加5% FBS(不含脂肪酸)的DMEM中稀释至终浓度为100μM,在室温水浴中超声15min,然后再进行预络合15min。

4.加入含Palmitic Acid Alkyne的培养基,24h后部分更换。

5.转染后72h,裂解细胞(含1% Triton x-100的PBS, 0.1% SDS, PIC),然后在4℃下,16000 g离心5min。

6.用Wessel-Flugge蛋白沉淀法沉淀裂解物。

7.将点击标记反应物[0.1mM叠氮生物素,1mM盐酸三(2-羧乙基)膦]溶于水中

8.与溶解于DMSO中的0.1mM Tris[(1-苄基- 1h -1,2,3-三唑-4-酰基)甲基]胺和溶解于水中的1mM CuSO4在37℃黑暗条件下混合摇动培养2h。

9.点击反应后,沉淀样品用10倍甲醇在- 80℃下过夜,然后离心,再次用冰冷的甲醇洗涤

10.将干燥后的颗粒在4% SDS中重悬。

11.用高容量中性琼脂糖树脂沉淀click-生物素化蛋白。

12.用1% SDS洗涤样品并洗脱,然后通过免疫印迹进一步分析。

*本实验方法仅供参考,具体步骤应根据您的具体需要进行修改

References:

1.Linnemannstöns, Karen et al. “Ykt6-dependent endosomal recycling is required for Wnt secretion in the Drosophila wing epithelium.” Development (Cambridge, England) vol. 147,15 dev185421. 14 Aug. 2020, doi:10.1242/dev.185421

化学性质

Cas No. 99208-90-9 SDF
别名 15-十六碳炔酸,Alk-14
化学名 15-hexadecynoic acid
Canonical SMILES C#CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O
分子式 C16H28O2 分子量 252.4
溶解度 20mg/mL in DMSO, 30mg/mL in DMF, 30mg/mL in ethanol 储存条件 Store at -20°C
General tips 请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液;一旦配成溶液,请分装保存,避免反复冻融造成的产品失效。
储备液的保存方式和期限:-80°C 储存时,请在 6 个月内使用,-20°C 储存时,请在 1 个月内使用。
为了提高溶解度,请将管子加热至37℃,然后在超声波浴中震荡一段时间。
Shipping Condition 评估样品解决方案:配备蓝冰进行发货。所有其他可用尺寸:配备RT,或根据请求配备蓝冰。

溶解性数据

制备储备液
1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.962 mL 19.8098 mL 39.6197 mL
5 mM 0.7924 mL 3.962 mL 7.9239 mL
10 mM 0.3962 mL 1.981 mL 3.962 mL
  • 摩尔浓度计算器

  • 稀释计算器

  • 分子量计算器

质量
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浓度
x
体积
x
分子量
 
 
 
*在配置溶液时,请务必参考产品标签上、MSDS / COA(可在Glpbio的产品页面获得)批次特异的分子量使用本工具。

计算

动物体内配方计算器 (澄清溶液)

第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
给药剂量 mg/kg 动物平均体重 g 每只动物给药体积 ul 动物数量
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶于水的药物;不同批次药物配方比例不同,请联系GLPBIO为您提供正确的澄清溶液配方)
% DMSO % % Tween 80 % saline
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