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TRIzol NC Reagent

目录号 : GK20010

TRIzol NC Reagent是无需使用氯仿的总RNA提取试剂,广泛适用于培养细胞、动物组织、植物组织等样本。

TRIzol NC Reagent Chemical Structure

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Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.

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Quality Control & SDS

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实验参考方法

自备材料:

异丙醇,75%乙醇(RNase-free ddH2O配制),RNase-free ddH2O。

 

Ⅰ.实验前的准备

提取RNA的关键是抑制细胞和环境中的RNA降解酶,防止所用设备和试剂中RNA降解酶的污染。因此,在实验中必须采取以下措施:戴一次性清洁手套和口罩;使用特殊的实验台进行RNA操作;操作过程中避免说话等。上述方法可以防止实验者的汗液和唾液的RNA降解酶污染。

 

注意:

1. 尽量使用一次性无酶无菌塑料耗材。如果使用玻璃器皿,应在使用前用37℃的0.1%DEPC水溶液处理12小时,然后在120℃高压灭菌30分钟以除去残留的DEPC。

2. 用于RNA实验的试剂必须采用干热(180℃,60min)灭菌或在DEPC水处理和灭菌后的玻璃容器中使用上述方法灭菌(也可使用无菌无核酶的一次性塑料容器),使用的无菌水必须用0.1%DEPC处理后再高压灭菌。

3. RNA实验用试剂和无菌水应专用,避免混合后交叉污染。

4. 本产品仅供科学研究使用,不得用于临床医学诊断及其他非合理用途。

5. 本产品中含有苯酚,具有毒性和腐蚀性,使用时应穿戴防护物品,如防护服装、手套、眼罩、面罩等。如果不慎接触到眼睛,应立即用大量的清水冲洗并前往医院治疗;接触到皮肤,请立即用大量去垢剂和清水冲洗,如仍有不适,请前往医院治疗。

 

Ⅱ实验操作

 

1. 样本处理

 

1.1动物/植物组织

1.1.1将新鲜组织剪碎,用液氮速冻,迅速转移至液氮预冷的研钵中,用研磨杵迅速研磨,期间不断加入液氮,直至研磨成粉末状。

注:研磨不彻底会影响RNA的得率和质量。

1.1.2 将研磨成粉的样品转移至离心管中,大约每50mg组织加入500μL TRIzol NC Reagent,涡旋振荡至充分裂解,室温静置5min。

注:每500μL TRIzol NC Reagent最多可裂解50mg动物/植物组织,过多的样本量可能会导致裂解不充分,并使产物纯度降低。肝脏、脾脏、肾脏等组织DNA/RNA含量丰富,过多样本量还会导致gDNA残留或产量降低。

注:若没有液氮研磨条件,可将新鲜组织尽量剪碎浸泡在TRIzol NC Reagent中,用电动匀浆器高速匀浆至组织块彻底裂解。

1.1.3 (优选)11,200rpm (12,000xg)室温离心5min。小心吸取上清至新的1.5ml离心管,切勿吸取沉淀。

注:若样本含有较多蛋白质、脂肪、多糖或肌纤维、植物块茎等,可离心去除不溶物质,离心得到的沉淀包含细胞膜、多糖、高分子量DNA等,而RNA存在于上清中。提取脂肪含量较高的组织样本时,若上层含有大量油脂,应去除。转移上清进行后续操作。

 

1.2悬浮细胞

1.2.1离心收集细胞,弃尽上清,每1x106-1x107个细胞加入500μL TRIzol NC Reagent。

1.2.2涡旋振荡或用移液器反复吹打直至充分裂解,室温静置5min。

注:对于冻存细胞,加入TRIzol NC Reagent应立即进行振荡,否则会导致裂解不充分。

 

1.3 贴壁细胞

1.3.1弃去细胞培养液,用1xPBS清洗一次,弃尽废液。

1.3.2常规6孔板每孔或直径3.5cm平皿(约10cm2培养面积)的细胞加入500μL TRIzol NC Reagent,使之充分覆盖细胞表面,然后用移液器反复吹打细胞使其脱落。

注:对于贴壁牢固的细胞(细胞团)可采用细胞刮或者洁净的枪头剥离,或将TRIzol NC Reagent 增加至1ml,亦可在加入TRIzol NC Reagent 之前用胰酶将细胞消化下来,然后按照悬浮细胞处理。

1.3.3 将裂解液转移至1.5ml离心管,涡旋振荡或用移液器反复吹打直至充分裂解,室温静置5 min。

 

2. RNA提取

2.1所得裂解液中加入Dilution Buffer。

2.1.1动物/植物组织:每500μL TRIzol NC Reagent加入100μL Dilution Buffer;涡旋振荡至溶液充分混匀,室温静置5min。

2.1.2细胞:每500μL TRIzol NC Reagent加入150μL Dilution Buffer。盖紧离心管盖,涡旋振荡至溶液充分混匀,室温静置5min。

注:振荡时注意使溶液充分混匀为均一溶液,混匀不彻底影响RNA提取效率和杂质去除效率。

2.2   11,200rpm(12,000xg)室温离心15 min。

2.3 小心取出离心管。此时样本中蛋白质、DNA、多糖等杂质沉淀到管底,RNA分布在上层溶液中,小心吸取上清溶液(约500μL)至一个新的离心管中 。

注:上层溶液的体积约占总体积的90%,用500μL TRIzol NC Reagent进行提取,上层溶液约为500μL;触碰到下层沉淀会导致基因组及杂质污染。

注:部分样本上清轻微浑浊或有颜色,可继续后续操作,不影响产量和纯度。

注:组织投入量为50mg时,吸取上清溶液体积建议减少至450μL,避免吸到下层沉淀。

 

2.4  在得到的上清溶液中加入等体积异丙醇,上下颠倒充分混匀,室温静置10min。

2.5  11,200 rpm(12,000xg)室温离心10min,离心后在管侧和管底可以看见白色凝胶状RNA沉淀,小心弃去上清,勿丢失沉淀。

注:RNA含量少会导致沉淀不明显,小心弃去上清,勿丢失沉淀。

注:为减少杂质残留,此步骤尽可能将上清弃干净。

2.6 离心管中加入1ml 75%乙醇(RNase-free ddH2O配制)清洗沉淀。轻弹管底,让沉淀悬浮起来,上下颠倒数次。

2.7  9,100rpm (8,000xg)室温离心3min,弃去上清,勿丢失沉淀。

2.8 重复步骤6和7一遍,弃尽上清。

注:为减少杂质残留,应尽可能的将上清液弃干净。建议弃去大部分上清后,短暂离心将所有液体甩至管底,再用10μL移液器将剩余液体吸掉,注意不要吸到沉淀。

2.9 超净工作台中吹干沉淀,加入20-100μL RNase-free ddH2O溶解沉淀,室温涡旋3min(或使用移液器反复吹打),使RNA沉淀充分溶解。提取的RNA产物可以分装后在-85~-65℃长期保存,在-30~-15℃短期保存。

注:通常,RNA沉淀晾干2-3min即可,不要过度晾干,RNA完全干燥后会很难溶解。RNA产物器要充分溶解,否则可能导致浓度定量失准。

Ⅲ 常见问题解决方案

常见问题

原因

解决方案

RNA产物溶解不完全

1.干燥时间过长

75%乙醇清洗后用10uL移液枪弃尽上清,控制干燥时间,避免过分干燥

2.产物量过多

增加RNase-free ddH2O投入量,延长溶解时间或55 ~ 60℃水浴加热2 - 3min

3.杂质过多

样本充分裂解后,离心取上清后再进行后续操作

RNA降解

1.存在RNase污染

确保所有离心管、枪头及相关溶液都必须无RNase污染;做好防护工作,戴口罩和一次性干净手套,并在单独的洁净区操作

2.样本保存不当或样本保存时间过久

采用新鲜样本或经液氮速冻后保存于-85 ~ -65℃的样本

3.样本反复冻融

样本保存时,建议分装后保存,避免因反复冻融导致的降解;从液氮中取出的样本应迅速加入裂解液并充分混合均匀,防止样本因置于室温时间过长或与裂解液混合不均匀导致RNA降解

4.电泳原因

电泳前将电泳槽用3%双氧水浸泡20min,然后用RNase-free ddH2O进行冲洗;电泳缓冲液用RNase-free ddH2O配制;更换新RNA专用的Loading Buffer

抑制下游或纯度低

1.蛋白质污染

减少样本起始投入量;增加TRIzol NC Reagent体积;勿触碰蛋白质沉淀

2.多糖污染

减少样本起始投入量

3.脂肪污染

建议增加1.1.3优选步骤

4.盐残留

增加75%乙醇漂洗次数

5.A260/230过低

增加75%乙醇漂洗次数

基因组

DNA污染

1.样本投入量过高

减少样本起始投入量

增加TRIzol NC Reagent体积

样本裂解时,加适量HAc (每500μl TRIzol NC Reagent加5μl)

逆转录时选择含有基因组去除模块的逆转录试剂,推荐使用SuperFast RT Master Mix for qPCR (gDNA remover)(Cat.No. GK10031)

设计引物时选用跨内含子的引物,避免基因组DNA模板参与扩增反应

加入异丙醇离心后看不见沉淀

1.样本投入量低或RNA 含量低

加入异丙醇后在2 ~ 8℃或-30 ~ -15℃放置10 - 30min后再离心

2.沉淀丢失

进行弃上清操作时,采用吸取而不是倾倒的方法,勿丢失沉淀

3.样本自身代谢产物多

沉淀会分散在离心管壁上,弃上清时沿液面缓慢吸取

各阶段保存时间

1. TRIzol NC Reagent 振荡混匀后

在4℃保存12h或-20℃保存一周

2.加入75%乙醇后

在4℃保存12h或-20℃保存72h

产品描述

TRIzol NC Reagent是无需使用氯仿的总RNA提取试剂,广泛适用于培养细胞、动物组织、植物组织等样本。

TRIzol NC Reagent提取过程大约1小时,获得的总RNA可直接用于RT-PCR,qRT-PCR,Northern Blot、Dot Blot、体外翻译和高通量测序等分子生物学实验。建议使用配套SuperFast RT Master Mix for qPCR (gDNA remover)(Cat.No. GK10031)逆转录试剂盒和SYBR Green qPCR Master Mix(Cat.No. GK10002)实时荧光定量PCR试剂盒。

 

Sample size and RNA yield

Sample type

Sample size

RNA yield

Leukocyte

1x106 cells

10~20μg

Plant tissue

50mg

10~25μg

Cells

1x106 cells

10-30μg

Tissues such as muscle/brain

50mg

10-25μg

Liver

50mg

100~300μg

 

本产品为蓝色溶液,提取RNA过程中,可将蛋白质、DNA、多糖等杂质沉淀于管底,且有明显蓝色沉淀分层,便于吸取RNA上清,可有效去除杂质,保证RNA的完整性和纯度。与传统TRIzol法相比,同等50mg组织样品需要添加0.5ml TRIzol NC Reagent,传统TRIzol Reagent需要添加1ml,更加节约试剂。本产品操作简便,可全程常温操作,并且无需使用氯仿进行分层,安全性更高。

TRIzol NC Reagent

图1 TRIzol NC与常规Trizol操作流程对比图

 

常见问题:

1. Q: 传统TRIZOL法提取RNA 需要4℃离心,该产品则是常温条件下提取RNA吗?

A:是的,TRIzol NC Reagent可以常温提取RNA,裂解液成分可以充分保护RNA不受降解。如果在冰上操作和4℃则更佳。

 

2. Q: 裂解液加入稀释液离心之后是否有分层?

 A:步骤2.2离心后可看见明显的蓝色下层沉淀和RNA上清液。

 

3. Q: 加入异丙醇离心后看不见沉淀?

A: 通常情况下,经过异丙醇沉淀可以看见白色胶状沉淀。若遇到沉淀不可见的情况,可能是RNA含量低或者组织投入量过低,建议加大投入量并增加TRIzol NC Reagent的使用量;且在步骤2.5-2.8弃上清操作时,采用吸取而不是倾倒的方法,以免沉淀丢失;取上层溶液,加5-10μg RNase-free糖原作为载体与RNA共沉淀。此外,部分组织材料由于含有较多的代谢产物,导致沉淀不能聚集而分散在离心管壁上,此时,请沿液面缓慢吸取上清,经过75%的乙醇清洗RNA沉淀之后,白色团块状沉淀会聚集和明显。

 

4. Q: 该产品的适用范围?

A: TRIzol NC Reagent可以提取细胞样品,动物植物组织样品。对血液样本不适用,对动物白色脂肪组织不适用。血液样本建议使用TRIzol LS Reagent(Cat.No. GK20009)。动物白色脂肪组织样本建议使用TRIzol Reagent(Cat.No. GK20008)。

产品组成

Components 100 rxns 200 rxns
TRIzol NC Reagent 50ml 100ml
Dilution Buffer 20ml 40ml

功能属性

应用&特点• Safe and low in toxicity: No need for toxic and harmful reagents such as chloroform and β-mercaptoethanol
• Ease to use: RNA extraction in a monophasic system, no phase separation, all operations at room temperature
• High RNA quality: High purity and integrity of RNA at a yield comparable to the traditional Trizol method
运输方式Ship with blue ice.
储存条件Store at 2-8°C, protected from light for 1 years.
用途仅供研究使用!不能用于人体。