TRIzol NC Reagent
目录号 : GK20010TRIzol NC Reagent是无需使用氯仿的总RNA提取试剂,广泛适用于培养细胞、动物组织、植物组织等样本。
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
自备材料:
异丙醇,75%乙醇(RNase-free ddH2O配制),RNase-free ddH2O。
Ⅰ.实验前的准备
提取RNA的关键是抑制细胞和环境中的RNA降解酶,防止所用设备和试剂中RNA降解酶的污染。因此,在实验中必须采取以下措施:戴一次性清洁手套和口罩;使用特殊的实验台进行RNA操作;操作过程中避免说话等。上述方法可以防止实验者的汗液和唾液的RNA降解酶污染。
注意:
1. 尽量使用一次性无酶无菌塑料耗材。如果使用玻璃器皿,应在使用前用37℃的0.1%DEPC水溶液处理12小时,然后在120℃高压灭菌30分钟以除去残留的DEPC。
2. 用于RNA实验的试剂必须采用干热(180℃,60min)灭菌或在DEPC水处理和灭菌后的玻璃容器中使用上述方法灭菌(也可使用无菌无核酶的一次性塑料容器),使用的无菌水必须用0.1%DEPC处理后再高压灭菌。
3. RNA实验用试剂和无菌水应专用,避免混合后交叉污染。
4. 本产品仅供科学研究使用,不得用于临床医学诊断及其他非合理用途。
5. 本产品中含有苯酚,具有毒性和腐蚀性,使用时应穿戴防护物品,如防护服装、手套、眼罩、面罩等。如果不慎接触到眼睛,应立即用大量的清水冲洗并前往医院治疗;接触到皮肤,请立即用大量去垢剂和清水冲洗,如仍有不适,请前往医院治疗。
Ⅱ实验操作
1. 样本处理
1.1动物/植物组织
1.1.1将新鲜组织剪碎,用液氮速冻,迅速转移至液氮预冷的研钵中,用研磨杵迅速研磨,期间不断加入液氮,直至研磨成粉末状。
注:研磨不彻底会影响RNA的得率和质量。
1.1.2 将研磨成粉的样品转移至离心管中,大约每50mg组织加入500μL TRIzol NC Reagent,涡旋振荡至充分裂解,室温静置5min。
注:每500μL TRIzol NC Reagent最多可裂解50mg动物/植物组织,过多的样本量可能会导致裂解不充分,并使产物纯度降低。肝脏、脾脏、肾脏等组织DNA/RNA含量丰富,过多样本量还会导致gDNA残留或产量降低。
注:若没有液氮研磨条件,可将新鲜组织尽量剪碎浸泡在TRIzol NC Reagent中,用电动匀浆器高速匀浆至组织块彻底裂解。
1.1.3 (优选)11,200rpm (12,000xg)室温离心5min。小心吸取上清至新的1.5ml离心管,切勿吸取沉淀。
注:若样本含有较多蛋白质、脂肪、多糖或肌纤维、植物块茎等,可离心去除不溶物质,离心得到的沉淀包含细胞膜、多糖、高分子量DNA等,而RNA存在于上清中。提取脂肪含量较高的组织样本时,若上层含有大量油脂,应去除。转移上清进行后续操作。
1.2悬浮细胞
1.2.1离心收集细胞,弃尽上清,每1x106-1x107个细胞加入500μL TRIzol NC Reagent。
1.2.2涡旋振荡或用移液器反复吹打直至充分裂解,室温静置5min。
注:对于冻存细胞,加入TRIzol NC Reagent应立即进行振荡,否则会导致裂解不充分。
1.3 贴壁细胞
1.3.1弃去细胞培养液,用1xPBS清洗一次,弃尽废液。
1.3.2常规6孔板每孔或直径3.5cm平皿(约10cm2培养面积)的细胞加入500μL TRIzol NC Reagent,使之充分覆盖细胞表面,然后用移液器反复吹打细胞使其脱落。
注:对于贴壁牢固的细胞(细胞团)可采用细胞刮或者洁净的枪头剥离,或将TRIzol NC Reagent 增加至1ml,亦可在加入TRIzol NC Reagent 之前用胰酶将细胞消化下来,然后按照悬浮细胞处理。
1.3.3 将裂解液转移至1.5ml离心管,涡旋振荡或用移液器反复吹打直至充分裂解,室温静置5 min。
2. RNA提取
2.1所得裂解液中加入Dilution Buffer。
2.1.1动物/植物组织:每500μL TRIzol NC Reagent加入100μL Dilution Buffer;涡旋振荡至溶液充分混匀,室温静置5min。
2.1.2细胞:每500μL TRIzol NC Reagent加入150μL Dilution Buffer。盖紧离心管盖,涡旋振荡至溶液充分混匀,室温静置5min。
注:振荡时注意使溶液充分混匀为均一溶液,混匀不彻底影响RNA提取效率和杂质去除效率。
2.2 11,200rpm(12,000xg)室温离心15 min。
2.3 小心取出离心管。此时样本中蛋白质、DNA、多糖等杂质沉淀到管底,RNA分布在上层溶液中,小心吸取上清溶液(约500μL)至一个新的离心管中 。
注:上层溶液的体积约占总体积的90%,用500μL TRIzol NC Reagent进行提取,上层溶液约为500μL;触碰到下层沉淀会导致基因组及杂质污染。
注:部分样本上清轻微浑浊或有颜色,可继续后续操作,不影响产量和纯度。
注:组织投入量为50mg时,吸取上清溶液体积建议减少至450μL,避免吸到下层沉淀。
2.4 在得到的上清溶液中加入等体积异丙醇,上下颠倒充分混匀,室温静置10min。
2.5 11,200 rpm(12,000xg)室温离心10min,离心后在管侧和管底可以看见白色凝胶状RNA沉淀,小心弃去上清,勿丢失沉淀。
注:RNA含量少会导致沉淀不明显,小心弃去上清,勿丢失沉淀。
注:为减少杂质残留,此步骤尽可能将上清弃干净。
2.6 离心管中加入1ml 75%乙醇(RNase-free ddH2O配制)清洗沉淀。轻弹管底,让沉淀悬浮起来,上下颠倒数次。
2.7 9,100rpm (8,000xg)室温离心3min,弃去上清,勿丢失沉淀。
2.8 重复步骤6和7一遍,弃尽上清。
注:为减少杂质残留,应尽可能的将上清液弃干净。建议弃去大部分上清后,短暂离心将所有液体甩至管底,再用10μL移液器将剩余液体吸掉,注意不要吸到沉淀。
2.9 超净工作台中吹干沉淀,加入20-100μL RNase-free ddH2O溶解沉淀,室温涡旋3min(或使用移液器反复吹打),使RNA沉淀充分溶解。提取的RNA产物可以分装后在-85~-65℃长期保存,在-30~-15℃短期保存。
注:通常,RNA沉淀晾干2-3min即可,不要过度晾干,RNA完全干燥后会很难溶解。RNA产物器要充分溶解,否则可能导致浓度定量失准。
Ⅲ 常见问题解决方案
常见问题 |
原因 |
解决方案 |
RNA产物溶解不完全 |
1.干燥时间过长 |
75%乙醇清洗后用10uL移液枪弃尽上清,控制干燥时间,避免过分干燥 |
2.产物量过多 |
增加RNase-free ddH2O投入量,延长溶解时间或55 ~ 60℃水浴加热2 - 3min |
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3.杂质过多 |
样本充分裂解后,离心取上清后再进行后续操作 |
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RNA降解 |
1.存在RNase污染 |
确保所有离心管、枪头及相关溶液都必须无RNase污染;做好防护工作,戴口罩和一次性干净手套,并在单独的洁净区操作 |
2.样本保存不当或样本保存时间过久 |
采用新鲜样本或经液氮速冻后保存于-85 ~ -65℃的样本 |
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3.样本反复冻融 |
样本保存时,建议分装后保存,避免因反复冻融导致的降解;从液氮中取出的样本应迅速加入裂解液并充分混合均匀,防止样本因置于室温时间过长或与裂解液混合不均匀导致RNA降解 |
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4.电泳原因 |
电泳前将电泳槽用3%双氧水浸泡20min,然后用RNase-free ddH2O进行冲洗;电泳缓冲液用RNase-free ddH2O配制;更换新RNA专用的Loading Buffer |
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抑制下游或纯度低 |
1.蛋白质污染 |
减少样本起始投入量;增加TRIzol NC Reagent体积;勿触碰蛋白质沉淀 |
2.多糖污染 |
减少样本起始投入量 |
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3.脂肪污染 |
建议增加1.1.3优选步骤 |
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4.盐残留 |
增加75%乙醇漂洗次数 |
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5.A260/230过低 |
增加75%乙醇漂洗次数 |
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基因组 DNA污染 |
1.样本投入量过高 |
减少样本起始投入量 |
增加TRIzol NC Reagent体积 |
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样本裂解时,加适量HAc (每500μl TRIzol NC Reagent加5μl) |
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逆转录时选择含有基因组去除模块的逆转录试剂,推荐使用SuperFast RT Master Mix for qPCR (gDNA remover)(Cat.No. GK10031) |
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设计引物时选用跨内含子的引物,避免基因组DNA模板参与扩增反应 |
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加入异丙醇离心后看不见沉淀 |
1.样本投入量低或RNA 含量低 |
加入异丙醇后在2 ~ 8℃或-30 ~ -15℃放置10 - 30min后再离心 |
2.沉淀丢失 |
进行弃上清操作时,采用吸取而不是倾倒的方法,勿丢失沉淀 |
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3.样本自身代谢产物多 |
沉淀会分散在离心管壁上,弃上清时沿液面缓慢吸取 |
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各阶段保存时间 |
1. TRIzol NC Reagent 振荡混匀后 |
在4℃保存12h或-20℃保存一周 |
2.加入75%乙醇后 |
在4℃保存12h或-20℃保存72h |
TRIzol NC Reagent是无需使用氯仿的总RNA提取试剂,广泛适用于培养细胞、动物组织、植物组织等样本。
TRIzol NC Reagent提取过程大约1小时,获得的总RNA可直接用于RT-PCR,qRT-PCR,Northern Blot、Dot Blot、体外翻译和高通量测序等分子生物学实验。建议使用配套SuperFast RT Master Mix for qPCR (gDNA remover)(Cat.No. GK10031)逆转录试剂盒和SYBR Green qPCR Master Mix(Cat.No. GK10002)实时荧光定量PCR试剂盒。
Sample size and RNA yield |
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Sample type |
Sample size |
RNA yield |
Leukocyte |
1x106 cells |
10~20μg |
Plant tissue |
50mg |
10~25μg |
Cells |
1x106 cells |
10-30μg |
Tissues such as muscle/brain |
50mg |
10-25μg |
Liver |
50mg |
100~300μg |
本产品为蓝色溶液,提取RNA过程中,可将蛋白质、DNA、多糖等杂质沉淀于管底,且有明显蓝色沉淀分层,便于吸取RNA上清,可有效去除杂质,保证RNA的完整性和纯度。与传统TRIzol法相比,同等50mg组织样品需要添加0.5ml TRIzol NC Reagent,传统TRIzol Reagent需要添加1ml,更加节约试剂。本产品操作简便,可全程常温操作,并且无需使用氯仿进行分层,安全性更高。
图1 TRIzol NC与常规Trizol操作流程对比图
常见问题:
1. Q: 传统TRIZOL法提取RNA 需要4℃离心,该产品则是常温条件下提取RNA吗?
A:是的,TRIzol NC Reagent可以常温提取RNA,裂解液成分可以充分保护RNA不受降解。如果在冰上操作和4℃则更佳。
2. Q: 裂解液加入稀释液离心之后是否有分层?
A:步骤2.2离心后可看见明显的蓝色下层沉淀和RNA上清液。
3. Q: 加入异丙醇离心后看不见沉淀?
A: 通常情况下,经过异丙醇沉淀可以看见白色胶状沉淀。若遇到沉淀不可见的情况,可能是RNA含量低或者组织投入量过低,建议加大投入量并增加TRIzol NC Reagent的使用量;且在步骤2.5-2.8弃上清操作时,采用吸取而不是倾倒的方法,以免沉淀丢失;取上层溶液,加5-10μg RNase-free糖原作为载体与RNA共沉淀。此外,部分组织材料由于含有较多的代谢产物,导致沉淀不能聚集而分散在离心管壁上,此时,请沿液面缓慢吸取上清,经过75%的乙醇清洗RNA沉淀之后,白色团块状沉淀会聚集和明显。
4. Q: 该产品的适用范围?
A: TRIzol NC Reagent可以提取细胞样品,动物植物组织样品。对血液样本不适用,对动物白色脂肪组织不适用。血液样本建议使用TRIzol LS Reagent(Cat.No. GK20009)。动物白色脂肪组织样本建议使用TRIzol Reagent(Cat.No. GK20008)。
Components | 100 rxns | 200 rxns |
TRIzol NC Reagent | 50ml | 100ml |
Dilution Buffer | 20ml | 40ml |
应用&特点 | • Safe and low in toxicity: No need for toxic and harmful reagents such as chloroform and β-mercaptoethanol
• Ease to use: RNA extraction in a monophasic system, no phase separation, all operations at room temperature • High RNA quality: High purity and integrity of RNA at a yield comparable to the traditional Trizol method |
运输方式 | Ship with blue ice. |
储存条件 | Store at 2-8°C, protected from light for 1 years. |
用途 | 仅供研究使用!不能用于人体。 |